食品自动化加工也面临着不同于其它行业的挑战：自动化制造需要有可预见的环境、大量均一产品以及简单的可重复动作，获得自动化制造成功的必需前提是产品的多样化范围要小于自动化制造系统的能力控制范围。与日用品及汽车制造相比，食品常常缺乏规则的形状以及有着不均一的尺寸及多变的组织结构，这是食品自动化加工所具有的独特挑战。

尽管食品加工业实施自动化的益处是显著的，但是食品加工业的自动化潜力还没有被完全开发出来，不仅仅是成本节省、增加产量，也包括了清洁卫生。但是食品工业中产品尺寸、形状的差异以及质构上的固有特性，使得自动化面临着特殊挑战。自动化设备工程师不但需要对产品的特性有着更清晰的认识，还需要清楚特定目的的自动化并最终使两者统一。最后，还需再次强调的是，自动化得以成功的唯一关键就是：自动化设备处理的范围要大于产品的范围。

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